苏通科技产业园位于苏通长江大桥北翼，是南通接轨上海、融入苏南的桥头堡。通过完善的高速公路、水路、铁路以及航空网与中国和世界的主要城市相连。同时南通位于中国沿海经济带和沿江经济带的交汇点，已融入上海一小时经济圈。园区距苏州40分钟车程、距上海60分钟车程、距无锡60分钟车程。

• 公路交通方面：沿海高速、宁通高速、江海高速、204国道、328国道等交通干线在南通交汇，园区拥有优越的交通优势。
• 过江通道方面：苏通大桥位于江苏省东部的南通市和苏州(常熟)市之间，西距南京约280公里，东距长江入海口约100公里。大桥北接沿海高速公路和宁启高速公路，南接苏嘉杭高速公路、沪宁高速公路以及江苏省沿江高速公路，是国家沿海高速公路跨越长江的重要枢纽。苏通大桥于2003年6月开工，2008年6月30日建成正式通车。除了苏通大桥以外，崇启大桥明年2011年年初建成通车，沪通铁路大桥也将于今年年底动工兴建，使园区完全融入苏南和上海。
• 航空运输方面：南通兴东机场是上海国际航空枢纽的骨干支线机场，目前已经开通北京、广州、深圳、重庆、天津、成都、青岛、武汉等10余条航线。园区距 兴东机场仅20分钟车程。另外，从园区出发，到上海虹桥机场和无锡硕放机场均为60分钟车程，到浦东国际机场120分钟车程。
• 港口运输方面：园区上游的南通港有万吨级码头38座，与全世界100多个国家、地区的300多个港口通航，能够停靠15万吨级大型船舶；另外，园区内也规划有两座5万吨级集装箱码头。
• 铁路运输方面：现状南通市域有宁启铁路（南京-南通）和新长铁路两条铁路。未来南通市域将新建宁启铁路（南通-启东）、通沪铁路、海洋铁路三条铁路，同时加强与港区的铁路联系，将建设通往狼山港区、江海港区、通海港区、如皋港区、吕四港区等铁路专用线。这使南通与周边地区的客货运联系能力大大加强，并为南通港港区提供大容量的集疏运条件。